首先是拆遷征收的流程不一樣，小產(chǎn)權(quán)房主要是農(nóng)村集體土地面上的住房，所以在拆遷時應(yīng)當(dāng)按照集體土地征收的流程辦理，由當(dāng)?shù)厥?、縣級政府組織發(fā)布相關(guān)材料并報省政府或者國務(wù)院批準(zhǔn)，獲得批準(zhǔn)后由市、縣級國土部門擬訂補償安置方案交由市、縣級政府批準(zhǔn)實施。

大產(chǎn)權(quán)房則由征收部門組織相關(guān)部門確定征收范圍、擬定征收補償方案并論證、聽證，落實征收補償費用。

其次大產(chǎn)權(quán)房和小產(chǎn)權(quán)房在征收補償方面也存在不同。

小產(chǎn)權(quán)房的上市交易受到國家嚴(yán)格限制，所以購買的小產(chǎn)權(quán)房由于合同效力以及產(chǎn)權(quán)變動存在缺點的，在遇到拆遷時，補償會存在較高風(fēng)險，一方面小產(chǎn)權(quán)房的購買人雖熱是實際居住人，但是卻難以獲得人員安置資格;另一方面一旦原房主在拆遷時反悔，主張買賣合同無效，小產(chǎn)權(quán)房的購買人可能承擔(dān)合同無效的風(fēng)險，此時拆遷補償款需要在購買人與原房主之間根據(jù)過錯程度進(jìn)行分配，小產(chǎn)權(quán)房的購買人經(jīng)過分配在拆遷中有可能只能獲得搬遷、裝飾裝修復(fù)償?shù)炔糠?。大產(chǎn)權(quán)房由于可以在自由買賣流通，無論是交易還是權(quán)屬登記都更有保證，在征收時對住房只需依照法律規(guī)定進(jìn)行登記和評估，就可以過得相應(yīng)的拆遷補償，并給予搬遷費，停產(chǎn)停業(yè)損失等費用。

由此可見，小產(chǎn)權(quán)房在征收拆遷時，被拆遷人往往面臨許多糾紛難以解決，所以在拆遷之時，小產(chǎn)權(quán)房的被征收人要盡早咨詢經(jīng)驗豐富的律師，避免自己處于劣勢。